Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl40Q9D783 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl40Q9D783 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms