Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nsmce1Q9D720 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsmce1Q9D720 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms