Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
4930449I24RikQ9D5E3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms