Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc7Q9D541 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc7Q9D541 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms