Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccdc130Q9D516 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc130Q9D516 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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