Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3404Q9D506 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms