Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rabl3Q9D4V7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rabl3Q9D4V7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms