Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Efhd1Q9D4J1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms