Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syce1Q9D495 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syce1Q9D495 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms