Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rufy3Q9D394 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rufy3Q9D394 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms