Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Susd3Q9D176 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Susd3Q9D176 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Susd3Q9D176 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Susd3Q9D176 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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