Protein–RNA interactions for Protein: Q9D061

Acbd6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd6Q9D061 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Acbd6Q9D061 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms