Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shisa9Q9CZN4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms