Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Xrcc3Q9CXE6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Xrcc3Q9CXE6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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