Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Utp23Q9CX11 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms