Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prkrip1Q9CWV6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms