Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BccipQ9CWI3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms