Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MINDY3Q9CV28 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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MINDY3Q9CV28 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MINDY3Q9CV28 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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