Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sycp2Q9CUU3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms