Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dis3Q9CSH3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms