Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Mrpl35Q9CQL6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl35Q9CQL6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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