Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb5Q9CQH3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufb5Q9CQH3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms