Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg3Q9CPX6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg3Q9CPX6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms