Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf2a1Q99PM3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms