Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b1Q99NB9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms