Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubqln4Q99NB8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ubqln4Q99NB8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Ubqln4Q99NB8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ubqln4Q99NB8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Ubqln4Q99NB8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubqln4Q99NB8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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