Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nmd3Q99L48 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms