Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ufsp2Q99K23 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufsp2Q99K23 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufsp2Q99K23 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufsp2Q99K23 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufsp2Q99K23 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ufsp2Q99K23 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms