Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smarcd2Q99JR8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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