Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
SptssbQ925E8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms