Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim59Q922Y2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms