Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Usp3Q91W36 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms