Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG6

Traip, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraipQ8VIG6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TraipQ8VIG6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms