Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ttc39cQ8VE09 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms