Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ttc8Q8VD72 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms