Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdk8Q8R3L8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cdk8Q8R3L8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms