Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MyripQ8K3I4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MyripQ8K3I4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms