Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rassf9Q8K342 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rassf9Q8K342 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms