Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Abcf3Q8K268 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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