Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Trim68Q8K243 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim68Q8K243 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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