Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd3Q8K1Y2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prkd3Q8K1Y2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms