Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nek9Q8K1R7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms