Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TwnkQ8CIW5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TwnkQ8CIW5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TwnkQ8CIW5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TwnkQ8CIW5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TwnkQ8CIW5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TwnkQ8CIW5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TwnkQ8CIW5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TwnkQ8CIW5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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