Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rftn2Q8CHX7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rftn2Q8CHX7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms