Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip3Q8CHD8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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