Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ClasrpQ8CFC7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms