Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Colec10Q8CF98 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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