Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp27Q8CEG8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp27Q8CEG8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp27Q8CEG8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Usp27Q8CEG8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms