Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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Lrrc9Q8CDN9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
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Lrrc9Q8CDN9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Lrrc9Q8CDN9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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Lrrc9Q8CDN9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc9Q8CDN9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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Lrrc9Q8CDN9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lrrc9Q8CDN9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lrrc9Q8CDN9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lrrc9Q8CDN9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc9Q8CDN9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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