Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc73Q8CDM4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms